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RNase R——RNase家族的“外貌協(xié)會(huì)成員”

作者:admin信息來(lái)源:達(dá)科為日期:2017年12月11日打印字體:  
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RNA酶,是一種將RNA水解成小分子核苷酸的核酸酶??珊?jiǎn)單分為外切核糖核酸酶和內(nèi)切核糖核酸酶。其中外切酶包括PNPase,RNase PH,RNase Ⅱ,RNase R,RNase D,RNase T,Oligoribonuclease,Exoribonuclease I,Exoribonuclease Ⅱ 等;內(nèi)切酶包括RNase A,RNase H,RNase I,RNaseⅢ,RNase L,RNase P,RNase PhyM,RNase T1,RNase T2,RNase U2,RNase V1,RNase V 等。

。

在成員眾多的RNase家族,就有這么一個(gè)“外貌協(xié)會(huì)”成員,它就是只針對(duì)線性RNA的RNase R。在介紹RNase R之前,先允許小達(dá)君給大家科普下環(huán)狀RNA~~

 


圖1. 線性RNA與環(huán)狀RNA


環(huán)狀RNA(Circular RNA,circRNA)是區(qū)別于線性RNA的一類新型環(huán)狀非編碼RNA,半衰期長(zhǎng),具有物種保守性和組織特異性。其獨(dú)特的環(huán)狀結(jié)構(gòu)使其不容易被RNA酶降解,因此在細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)定性很強(qiáng),在新型生物標(biāo)記、生物學(xué)機(jī)制研究等方向具有巨大的潛力和研究?jī)r(jià)值。

 


圖2. 環(huán)狀RNA的穩(wěn)定性


“cicrRNA”這一概念較早出現(xiàn)在1971年,在RNA病毒中被發(fā)現(xiàn),但長(zhǎng)期以來(lái),由于其表達(dá)豐度很低,所以一直被認(rèn)為是轉(zhuǎn)錄的“噪音”,沒(méi)有實(shí)際作用。

 


圖3. 環(huán)狀RNA的miRNA海綿作用


直到2012年,Salzman的一篇環(huán)狀RNA文章為其正名,于是大量的研究者涌入這個(gè)領(lǐng)域,不斷產(chǎn)出環(huán)狀RNA的研究成果。目前研究較多的就是位于細(xì)胞質(zhì)中的外顯子形成的環(huán)狀RNA,其含有大量miRNA結(jié)合位點(diǎn),可起到miRNA海綿作用,結(jié)合并封閉miRNA的調(diào)控作用,從而使其靶基因表達(dá)增強(qiáng)。

 


圖4. RNase R分離套索RNA


隨著環(huán)狀RNA的深入研究,環(huán)狀RNA制備問(wèn)題就越來(lái)越備受關(guān)注。Lucigen提供大腸桿菌來(lái)源的RNase R,是一種Mg依賴性的3’ →5’核糖核酸外切酶,能消化基本上所有線性RNA,但不消化套索或環(huán)狀RNA的結(jié)構(gòu),或者3’突出短于7個(gè)核苷酸的雙鏈RNA。即是除了tRNA,5S RNA和內(nèi)含子套索結(jié)構(gòu)外,大多數(shù)細(xì)胞RNA都將被RNase R完全消化。如圖4,RNase R可從總RNA中分離出內(nèi)含子前體mRNA剪切產(chǎn)生的套索RNA。以這種方法獲得的RNA作為模板來(lái)生產(chǎn)標(biāo)記的cDNA,可作為含有潛在的內(nèi)含子序列的微陣列的目標(biāo),或者用于包含完整的染色體或者基因組的重疊區(qū)域平鋪陣列。產(chǎn)生的cDNA不代表線性內(nèi)含子,但其含有的序列是來(lái)源于內(nèi)含子的。

 

應(yīng)用

1.選擇性剪切研究

2.基因表達(dá)研究

3.內(nèi)含子cDNA制備

4.cDNA文庫(kù)內(nèi)含子篩選

5.剪切中間體和套索RNA分離

 

產(chǎn)品信息 

產(chǎn)品

名稱

貨號(hào)

規(guī)格

網(wǎng)站

報(bào)價(jià)

廠家

RNase R

RNR07250

250U

¥2,916

Lucigen(epicentre)


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